منهجية التحقيق:
اعتمدنا في تحقيق الكتاب على ثلاث نسخ:
الأولى: النسخة المحفوظة في مكتبة آية الله المرعشي العامة، الكتاب الثالث ضمن المجموعة المرقمة (444)، من ص 186 إلى ص 249، كتبها صفر كرماني بخط النسخ الواضع يوم الاثنين 27 ذي القعدة سنة 1087 ه‍، على نسخة اخذت من الشيخ محمد العاملي في الشام، وفي آخر الكتاب توجد عبارة (بلغ مقابلة بعون الله تعالى وحسن توفيقه)، كما كتب الشيخ يوسف النجفي تلميذ تلميذ الشهيد الثاني في آخر صفحة من المجموعة أنه قابل النسخة، وأنهى مقابلتها يوم الأربعاء 9 ربيع الأول سنة 1088 ه‍.
تقع المجموعة في 320 ورقة، وكتابنا في 63 ورقة، في كل ورقة 16 سطرا، بحجم 5 / 20 × 5 / 10 سم، وقد رمزنا لهذه النسخة في هامش الكتاب ب‍ (ش).
الثانية: النسخة المحفوظة في مكتبة جامعة طهران تحت رقم 1017، كتبها بخط النسخ حسين بن مسلم بن حسين بن محمد الشهير بابن شعير العاملي، تلميذ الشهيد الثاني نحو سنة 954 ه‍، تحتوي النسخة على مقدمة الكتاب وبعض من الباب الثاني والثالث والرابع، توجد في ورقة 73 ب عبارة (تمت 954) بخط آخر، وفي ورقة 69 ألف توجد عبارة (ثم بلغ قراءة وفقه الله تعالى) بخط الشهيد الثاني.
تملك النسخة كل من علي بن محمد حسين الموسوي الشوشتري في 15 ج 2 سنة 1268 ه‍، وعلي بن حسين بن محمد علي بن زين الدين الموسوي وعلي محمد الموسوي.
ورق النسخة من النوع السمرقندي بحجم 14 × 5 / 18 و 5 / 8 × 13 س 17.
وقد رمزنا لهذه النسخة ب‍ (د).
انظر فهرس مكتبة جامعة طهران، الجزء الثالث، القسم الأول، ص 679.
الثالثة: النسخة المطبوعة على الحجر في إيران، كتبها ابن علي أكبر الجيلاني في يوم الاثنين 26 صفر سنة. 1310 ه‍ في طهران، وقد رمزنا لها في هامش الكتاب ب‍ (ح).