رئاسة الأزهر لم يزل مستمرا على ملازمة التدريس مع القيام بشؤون المشيخة. وكان عباس باشا يزوره في درسه بالأزهر ولا يقوم له بل يهيئ له كرسيا من جريد يجلس عليه خارج الدرس. ولم يزل الشيخ على هذا الحال إلى أن كبر سنه. وحصل بالأزهر حوادث أوجبت إقامة أربعة وكلاء عنه للقيام بواجبات الوظيفة تحت رئاسة الشيخ مصطفى العروسي 1 التحفة الخيرية وهي حاشية على الفوائد الشنشورية (فرائض المذاهب الأربعة) أولها: الحمد لله الذي يرث الأرض ومن عليها وهو خير الوارثين أتمها تأليفا سنة 1236: مط شاهين 1282 مط محمد مصطفى 1300 المط الأزهرية 1306 ص 280 الميمنية 1308 ص 226 2 تحفة المريد على جوهرة التوحيد لبرهان الدين اللقاني. وبالهامش الجوهرة المذكورة بولاق 1293 مط وادي النيل 1279 الميمنية 1306 ص 128 الأزهرية 1310 ص 126 3 تحقيق المقام على كفاية العوام فيما يجب عليهم من علم الكلام وهي حاشية على كفاية العوام للفضالي أول الحاشية: الحمد لله العالم بالكليات والجزئيات..
ألفها باذن شيخه (الفضالي) وفرغ من جمعها سنة 1223 بهامشها كناية العوام المذكور بولاق 1285 و 1291 و 1309 ص 81 مط الأزهرية 1298 الوهبية 1298 الخيرية 1303 مط عبد الرازق 1306 الميمنية 1328 4 حاشية الباجوري على أم البراهين والعقائد للسنوسي (توحيد) بهامشها تقرير الشيخ احمد الأجهوري بولاق 1293 ص 68 مصر 1300 و 1301 و 1302 بهامشها تقرير الشيخ الانبابي طبع حجر مصر 1279 و 1283 و 1289 ص 88 و 1298 و 1304 و 1307 و 1310 و 1318